Інститут фізики атмосфери (ÚFA) Академії наук Чеської Республіки був заснований 1 січня 1964 року. Дослідницька діяльність наразі охоплює всю атмосферу Землі - від приземного шару до міжпланетного простору. В Академії наук Чеської Республіки ÚFA належить до середніх інститутів - у ньому працює понад 80 співробітників, більшість з яких мають вищу освіту. Інститут поділяється на чотири наукові відділи та одну дослідну групу. Базується в Празі 4, Spořilov.
Департамент метеорології вивчає методи, які можуть уточнювати місцевий прогноз метеорологічних явищ (наприклад, опадів або штормів), обробляючи результати числових моделей прогнозу погоди. Він також займається математичним моделюванням течії в прикордонному шарі атмосфери (найближчої до земної поверхні частини атмосфери) і розповсюдження шкідливих домішок в атмосфері. Важливе значення має також вивчення впливу хмарності й опадів на загасання електромагнітних хвиль в атмосфері й інтерпретація вимірювань метеорологічних радіолокаторів. Останніми роками також приділяється увага дослідженню причин екстремальних опадів на нашій території. До складу відділу входять обсерваторії Мілешовка і Кописті. Мілешовка (837 м над рівнем моря) є найдовшою діючою гірською метеорологічною станцією в Чехії - кліматологічні спостереження тут проводяться практично безперервно з 1905 року. Довга серія спостережень є цінним джерелом інформації для вивчення зміни клімату . Останніми роками в Мілешовці також вимірювали ультрафіолетове випромінювання та брали проби води з туману. Кописти у Мосту (240 м н.р.м.) — у Подорушногірському вугільному басейні; там автоматично вимірюються вертикальні профілі вітру, температури та вологості на щоглі висотою 80 метрів.
Кафедра кліматології та аерономії бере участь у дослідженні двох основних глобальних проблем в атмосфері Землі, а саме довгострокових змін клімату та виснаження озонового шару. Зокрема, відділ займається аналізом спостережуваних змін і мінливості клімату та оцінкою змін, які можуть відбутися найближчим часом через посилення парникового ефекту; потім шляхом поглиблення знань про озоносферу та вивчення можливостей прогнозування змін загального озону в атмосфері. Співробітники відділу також досліджують вплив сонячної та геомагнітної активності на атмосферу та іоносферу, а також вплив подій у нейтральній атмосфері на іоносферу. Частиною відділу є іоносферна обсерваторія в Пругоніце.